臨時組合屋的完成，確實解決了災民的短期安置問題。民國89年6月日，前行政院長唐飛一次巡視921震災災區，為確保臨時住宅的安全，唐院長特指示於颱風來襲前辦理防颱加固設施，以預防颱風來襲造成臨時住宅倒塌。

　　行政院九二一震災災後重建推動委員會，隨即於7月4日召開「研商臨時性住宅（組合屋）防颱加固設施執行會議」，並交由本署研擬對策，由於颱風季節已屆，時效相當急迫加上民間興建之臨時住宅社區其屋頂樣式與構造種類均有所不同，故於參考阪神地震臨時住宅防颱加固作法研提防颱加固方式，僅針對臨時住宅主體架構（主桁架）加固施作，以確保臨時住宅不致因颱風來襲，產生側向傾倒。

　　經本署自行規劃設計後，隨即於7月26日、8月1日、8月8日及8月26日陸續完成發包，趕工完成了5千餘戶組合屋的加固設計與施工，並於碧利斯颱風來襲期間，安然通過考驗。

　　此外，鑑於碧利斯颱風來襲期間，曾發生災民自行興建之組合屋屋頂被強風掀落之情形，導致政府分配進住之臨時住宅現住戶對家居環境安全產生疑慮與不安，由於民間團體捐建之臨時住宅其屋頂材質、構造、樣式及組合方式均有甚大差異，為消除居民對安全之疑慮，本署便函請行政院九二一震災災後重建推動委員會，儘速籲請縣市政府洽商原捐建單位及營造廠自行檢視各臨時住宅社區屋頂構造耐風性能，必要時由各縣市政府或鄉鎮公所配合編製屋頂加固設施預算書圖辦理改善，重申政府照顧災民的全面考量。